Koene is getrouwd met Margje Pit op 29 apr 1882 in Steenwijkerwold. Margje (dochter van Jan Pit en Jacobjen Veen) is geboren op 29 jul 1854 in Zuidveen; is gestorven op 14 mei 1937 in Zuidveen; is begraven in Steenwijk. [Gezinsblad] [Familiekaart]

1. Roelof Bijkerk is geboren op 19 jan 1883 in Steenwijkerwold; is gestorven op 20 feb 1972 in Paasloo.
2. Jacoba Bijkerk is geboren op 2 nov 1884 in Steenwijkerwold; is gestorven op 24 feb 1975 in Paasloo.
3. Aaltje Bijkerk is geboren op 25 sep 1886 in Zuidveen; is gestorven op 20 aug 1938 in Zwolle.
4. Jantje Bijkerk is geboren op 29 dec 1888 in Steenwijkerwold; is gestorven op 5 dec 1975 in Steenwijkerwold.
5. Jan Bijkerk is geboren op 7 jun 1891 in Zuidveen; is gestorven op 5 okt 1961 in Heerenveen.
6. Klaas Bijkerk is geboren op 21 nov 1893 in Zuidveen; is gestorven op 25 okt 1964 in Steenwijk.
7. Trijntje Bijkerk is geboren op 12 mei 1896 in Zuidveen; is gestorven op 14 nov 1970 in Giethoorn.
8. Jan Bijkerk is geboren op 9 dec 1898 in Steenwijkerwold; is gestorven op 17 sep 1994 in Kallenkote.